Het heiligdom is een van de meest bedreigde wouden van de Andes, maar tegenwoordig beschermt het reservaat biodiversiteitssoorten die elders verdwijnen. Het heiligdom zet ook veel inspanningen in voor onderwijs aan toeristen en de lokale gemeenschap over het behoud van de regio. Otun Quimbaya’s Flora en Fauna Sanctuary is een top 100 duurzame bestemming van Green Destinations.
De Otun Quimbaya Fauna and Flora Sanctuary wordt beheerd door de Communitarian Association Yarumo Blanco via een contract met Colombiaanse Nationale Natuurparken. Deze duurzame bestemming, met als belangrijkste doel duurzaam en verantwoord toerisme, wil om de lokale gemeenschap in het gebied en bezoekers voor te lichten over het behoud door het toerisme, het stroomgebied van de Otun rivier te behouden en als onderdeel van het Coffee Cultural Landscape UNESCO Heritage. De verbintenis van de vereniging omvat de bescherming van bedreigde soorten volgens de CITES-conventie, de bescherming van het culturele erfgoed en de preventie van seksuele en commerciële exploitatie van kinderen en adolescenten.